这两个字,楼主所言正确。在一般书籍处理中以【鲇】为佳。
1、《通用字表》规定的是出版物中实际语用推荐用字,如楼主所说没有【鲶】,那就说明该字不推荐使用,在正规出版物中逐步进入淘汰之列;而他表的功能不同,在讨论具体问题应该有所区别。其实各个国标之间如《汉字归部集》等内部是有矛盾的。这我们也没办法,因为标准起草者不同,关注的角度都不同。
2、【鲇】【鲶】相比,前者笔画较少,便于识别记忆,符合汉字简化的一般趋势,故《通用字表》愿意收录前者。
3、《现汉》6版以【鲇】为主条,将【鲶】做表外异体字处理(上头有两个星星),是遵循了《通用字表》的规范,是正确合理的。一般而言,语文工具书对国家的规范比较敏感,而一般的书刊或其他专业的书籍未必关注到国家的相关语言文字规范。